研(yán )究人員介紹,Stereopy配置了3種算法,其中(zhōng )Stereopy-CCD算法能夠精準(zhǔn)識別疾(jí )病樣本與正(zhèng )常樣本的細(xì)胞(bāo )群落差(chà )異(yì );Stereopy-TGPI算法首次實(shí)現(xiàn)了時空(kōng )維度聯(lián)合解析,同時(shí )考慮基(jī )因在空間分布和時(shí )序變化上的一致(zhì )性,不僅可以識別發(fā)(fā )育過(guò )程中連續(xù)變化的基因,還可(kě )以(yǐ )建立動態(tài)時序基因調(diào)控網(wǎng)(wǎng )絡(luò),破解發(fā)育與疾病進(jìn)程的分子密碼;Stereopy-NicheReg3D算法突破了二維限制,以單細(xì)胞(bāo )分辨率重建(jiàn )三維細(xì)胞微環(huán)境。通(tōng )過整合細(xì)(xì )胞間通(tōng )信和(hé )基因調(diào)控(kòng )網(wǎng)絡(luò)模型,Stereopy提高(gāo )了針對特(tè )定情境(jìng )預(yù)測的準(zhǔn)確性,為器官發(fā)生研究提(tí )供了全新視角(jiǎo )。
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